Nếu được bổ nhiệm thủ tướng, Andrej Babiš sẽ rơi vào xung đột lợi ích vì Agrofert nhận trợ cấp nhà nước. Tổng thống Cộng hòa Séc Petr Pavel yêu cầu ông giải quyết trước và công khai bước đi; sau tuyên bố từ bỏ Agrofert, ông sẽ được bổ nhiệm vào 9 giờ sáng ngày 9/12. Babiš khẳng định sẽ không còn sở hữu hay liên hệ với công ty.

Bước đi dự kiến là chuyển toàn bộ cổ phần Agrofert vào quỹ ủy thác theo mô hình gần với quỹ “mù”. Cách làm này thường dùng ở nước ngoài nhưng pháp luật Séc không định danh. Về hình thức, đây lặp lại cách năm 2017, song lần này Babiš tuyên bố “vĩnh viễn” rời bỏ doanh nghiệp.

Khác với năm 2017, ông sẽ mất quyền đòi lại cổ phần sau khi kết thúc sự nghiệp chính trị và không còn ảnh hưởng đến mọi quyết định trong quỹ. Ông và người thân sẽ không được hưởng lợi tài chính từ Agrofert cho đến khi ông qua đời.

Về sở hữu tương lai, Babiš nói việc đưa cổ phần vào cấu trúc ủy thác là không thể đảo ngược; con cái ông mới có thể quyết định sau khi ông mất. Chuyên gia pháp lý Ondřej Preuss (DostupnyAdvokat.cz) cảnh báo tính độc lập của người quản lý và việc ngăn cổ phần quay lại tay Babiš còn phụ thuộc chi tiết thiết kế quỹ. Cổ phần sẽ do một quản lý độc lập điều hành và có người bảo trợ giám sát, những người này không được liên hệ với Babiš hay gia đình; người sáng lập quỹ sẽ chỉ định các cá nhân độc lập.

Chi tiết vận hành vẫn chưa rõ, như ai sẽ bổ nhiệm ban điều hành hay ban kiểm soát Agrofert. Người quản lý không được bán cổ phần nếu điều lệ quỹ cấm. Sau khi Babiš qua đời, các con sẽ nhận lại tập đoàn; tỷ lệ phân chia phụ thuộc quy định chi tiết của quỹ.

Tính dứt điểm của giải pháp với xung đột lợi ích còn gây tranh luận. Petr Jakubec thuộc Hiệp hội Hỗ trợ và Phát triển Quỹ ủy thác (Asociace pro podporu a rozvoj svěřenských fondů) cho rằng hiệu lực phụ thuộc vào pháp luật áp dụng và các quy tắc cụ thể của quỹ, có thể còn kẽ hở. Marie Zámečníková từ Khoa Luật Đại học Masaryk (Právnická fakulta Masarykovy univerzity) nhận định nếu Babiš không thể ảnh hưởng quản lý hay người bảo trợ, giải pháp có thể đáp ứng yêu cầu luật về xung đột lợi ích ở khía cạnh trợ cấp. Preuss bổ sung rằng khó loại bỏ hoàn toàn ảnh hưởng gián tiếp vì luôn có nguy cơ “tự kiểm duyệt” các quyết định liên quan Agrofert.