Chỉ ít ngày sau khi trở thành Lãnh tụ Tối cao, Mojtaba Khamenei được cho là bị thương trong các đòn tấn công Mỹ‑Israel khiến cha ông, Ayatollah Ali Khamenei, cùng nhiều người thân thiệt mạng. Alan Eyre, cựu chuyên gia Iran tại Bộ Ngoại giao Hoa Kỳ (U.S. Department of State), hiện là Distinguished Diplomatic Fellow tại Viện Trung Đông (Middle East Institute), nhận định ưu tiên của Khamenei lúc này là bảo toàn tính mạng và tiếp tục rút khỏi công chúng; tính kín tiếng vốn có của ông vì vậy càng được củng cố.

Eyre cho rằng nếu chiến tranh chấm dứt và ông còn sống, Khamenei nhiều khả năng sẽ đẩy mạnh sự hiện diện công khai. Theo ông, cái chết của Khamenei cũng không đồng nghĩa chấm dứt mô hình “Velayat‑e Faqih”, dù nền tảng thần quyền của hệ thống này đã xói mòn đáng kể khi Iran ngày càng mang dáng dấp một nhà nước an ninh‑quân sự.

Thông tin về tình trạng sức khỏe của Khamenei còn mâu thuẫn: Hãng Thông tấn Cộng hòa Hồi giáo (Islamic Republic News Agency) gọi ông là “cựu binh bị thương” trong cuộc chiến mà họ nói Mỹ và Israel bắt đầu ngày 28/2. Báo The Jerusalem Post (The Jerusalem Post) dẫn nguồn ẩn danh nói ông bị thương nhẹ và vẫn điều hành, tương tự hãng tin Reuters (Reuters). Báo The New York Times (The New York Times) trích quan chức Iran và Israel cho biết ông bị thương ở chân và đang lánh mặt vì lý do an ninh.

Đại sứ Iran tại Cộng hòa Síp, Alireza Salarian, xác nhận Khamenei bị thương ở tay và chân, hiện chưa đủ thoải mái để xuất hiện công khai. Yousef, con trai Tổng thống Masoud Pezeshkian, nói trên Telegram rằng ông nghe tin Khamenei bị thương nhưng hiện “ổn định”.

Trái với người cha thường xuyên xuất hiện và diễn thuyết, Khamenei thiên về nghiên cứu tôn giáo và gây dựng ảnh hưởng trong Vệ binh Cách mạng Hồi giáo (Islamic Revolutionary Guard Corps, IRGC), nơi ông từng phục vụ thời chiến Iran‑Iraq 1980‑1988. Dù tổn thất nặng, nhất là từ “cuộc chiến 12 ngày” Israel khởi động tháng 6 năm trước, IRGC vẫn đóng vai trò mũi nhọn trong chiến sự và hiện diện sâu rộng trong an ninh, chính trị, kinh tế.

Nhánh dân quân Basij (Basij) của IRGC, gắn chặt với Khamenei, đã được kích hoạt để trấn áp các cuộc biểu tình toàn quốc hồi tháng 1 và tiếp tục là trụ cột duy trì trật tự trong xung đột với Mỹ và Israel. Raz Zimmt từ Viện Nghiên cứu An ninh Quốc gia (Institute for National Security Studies), từng theo dõi Iran cho Lực lượng Phòng vệ Israel (Israel Defense Forces, IDF), nhận định một lãnh đạo mới thiếu chức vụ chính thức như Khamenei sẽ cần sự cố vấn và hậu thuẫn của IRGC; họ có thể tận dụng điều này để gia tăng ảnh hưởng và nhiều khả năng đã đóng vai trò quan trọng trong việc tiến cử ông.

Quyết định chọn Khamenei vấp phản đối ở Mỹ và Israel. Tổng thống Mỹ Donald Trump bày tỏ bất bình và ám chỉ Nhà Trắng (White House) nên có tiếng nói, trong khi giới chức Israel công khai đe dọa tấn công; khi Hội đồng Chuyên gia (Assembly of Experts) gồm 88 thành viên nhóm họp để phê chuẩn, IDF cảnh báo bằng tiếng Ba Tư sẽ truy đuổi mọi người kế vị và cả người toan bổ nhiệm. Trả lời kênh CNN (CNN), Ngoại trưởng Israel Gideon Saar giữ thái độ “chờ xem” về việc nhắm mục tiêu Khamenei và kỳ vọng ông tiếp tục các chính sách cứng rắn của cha. Theo Zimmt, tương lai của Khamenei phụ thuộc vào quyết định và khả năng của Washington và Tel Aviv; nếu sống sót, ông có thể còn cứng rắn hơn, sẵn sàng chấp nhận rủi ro, kể cả về hạt nhân, trong bối cảnh mối liên hệ chặt chẽ với IRGC gây lo ngại cho người dân Iran và khu vực.